未來我夢漫長且龐大的《新絕地組織》系列完結了，但主角們的冒險仍將繼續。緊接著他們將面對的是《黑巢三部曲》（The Dark Nest Trilogy，2005）所帶來的「黑巢危機」（Dark Nest Crisis），相較於之前，這個系列將焦點再次集中在路克、莉亞、韓三人的身上。在這個強敵已敗的和平時期，銀河聯盟取代了昔日的新共和，引領銀河邁入前所未有的統合局勢，絕地武士團也在路克等人努力下重新站穩腳跟，乍看下前景似乎一片光明，但出乎意料的分裂威脅已悄然逼近。
約二十七年前，韓與莉亞完成了終身大事後，曾前往塔圖因進行一項任務，過程間莉亞探詢了自己生父：安納金天行者昔日的足跡，終解開心結，與身上這條「維德的血脈」和好，懷了雙胞胎。實際上，他們本次目的是要取回一幅藏有反抗軍暗碼的畫作「克利克黃昏」（Killik Twilight），出自奧德朗畫家之手，由該星特有種苔癬所製，上頭描繪了一種昔日曾存在奧德朗，但於數千年前消失的神秘昆蟲種族。雖當時韓與莉亞未能取得這幅畫，卻依舊成功解除了密碼危機，直至二十年後，隨著遇戰瘋戰爭結束，帝國統帥斐列恩將這幅奧德朗的遺物歸還給了莉亞，作為感謝彼此互助情誼的禮物。
聯結之王
堪稱史上最慘烈的遇戰瘋戰爭終於結束，經過了六年的重建與恢復，銀河如今正朝著下一個時代邁進。在這場死傷高達天文數字的大戰中，路克的新絕地組織也受到了重大的打擊，人數足足銳減了一半，亦失去雅汶 4 的絕地學院。今天，以奧瑟斯作為新的總部，絕地武士團得以漸漸走出傷痛，再次擔起銀河和平守護者的重責大任。在這諸多事務好不容易步上軌道的時刻，來自奇斯優勢的使節造訪了銀河聯盟，提出抗議，聲稱一群絕地介入了他們的邊境衝突。
在國家元首奧瑪斯指示下，一頭霧水的天行者夫婦帶著他們年幼的兒子班，和絕地大師薩巴（Saba Sebatyne）一同啟程，前往未知星域調查真相。因應路克等人暫時的離席，絕地大師凱普杜倫聯繫韓與莉亞，欲請他們補上空缺，卻適得其反，索羅夫婦也乘千年鷹尋路克腳步而去。在行星優果依（Yoggoy）上，天行者與索羅見到了被稱為殖民地的蜂巢，遭遇名為克利克（Killik）的昆蟲種族，並見到了出乎意料的老面孔：在遇戰瘋戰爭中失去下落，被認為已死的絕地瑞納圖爾（Raynar Thul）。
克利克是一種知性昆蟲種族，他們在遙遠的過去離開了奧德朗但並未滅絕，於未知星域建立了巢穴，就這樣繁衍至今。克利克族擁有所謂的「蜂巢集體意識」，可藉由心電感應彼此溝通，並將一切個體都統合在集體意志底下，更特別的是，他們也能接納外來的其他種族，將之也納入蜂巢意識，稱為聯結者（Joiner）。八年前，在瑪卡任務中瑞納遭到黑暗絕地蘿米普羅（Lomi Plo）與韋爾克（Welk）綁架，三人所搭乘的船最終墜落於優果依，身受重傷的瑞納被克利克族納入了群體意識，然而他的個人特質影響了蜂群，反過來接管並成為蜂巢的領袖「聯結之王」（Joiner King）。
如今被稱為瑞納圖爾的個體已不存在，取而代之的是領導蜂群的烏努圖爾（UnuThul），藉由對原力的敏感性與知識，他得以改善克利克族的生活，領導殖民地展開擴張。儘管圖爾抱持和平的態度，這革新卻還是帶來了必然的負面影響，首當其衝就是被進犯了邊境的奇斯族，衝突因而爆發。圖爾以原力呼喚了昔日瑪卡任務的同伴們，珍娜、塔希里、洛巴卡等人，還有剛結束探尋之旅的傑森，紛紛前來加入蜂巢成為聯結者，如今這幾名絕地武士正在奎力卜（Qoribu）的前線幫助克利克對抗奇斯的部隊。
鑒於聯結者絕地已失去了中立性，路克等人前往奎力卜，命令所有人返回奧瑟斯，過程間卻遭遇藍色克利克攻擊，圖爾否認指使，並表示對此一無所知。然而在薩巴大師被同一批蜂群攻擊受了重傷，並在襲擊者中見到黑暗絕地韋爾克的身影，一切有了巨大的改變。絕地們回到奧瑟斯的新絕地聖殿商討解決方案，提列克族的女性絕地阿蕾瑪‧拉爾（Alema Rar）卻顯現出了高度的聯結者特徵，並與藍色的克利克刺客一同叛逃，自奧瑟斯脫離。阿蕾瑪是昔日瑪卡任務的成員，她的姊妹死於遇戰瘋戰爭，至今仍無法釋懷，心中這股負面情緒如今被黑暗勢力利用，將之變成了最強大的武器。
分析研究了聯結者的性質後，絕地組織得出結論，雖然優果依蜂巢的圖爾表面上統帥了克利克族，但實際上還有著如同群體潛意識的「黑巢」（Dark Nest）存在。這個由藍色克利克所組成，名為哥洛戈（Gorog）的蜂巢，極有可能是由同樣從墜機中生還的黑暗絕地蘿米普羅與韋爾克所領導，在暗中操控著整起衝突事件。藉由故意放跑阿蕾瑪，絕地得以追尋她的行蹤，找到這個巢穴的正確位置。另一方面，為了解決紛爭，傑森前往哈普茲財團，請求現任女王兼昔日好友譚妮兒協助克利克。對方同意出兵，代價是要傑森陪她一晚。
以奎力卜為舞台，最關鍵的戰役爆發，賈古德費爾領軍的奇斯部隊如今得面對哈普茲與克利克的聯合軍勢，莉亞與韓周旋在兩方之間卻徒勞無功。好在路克找到了位於奎力卜衛星上的黑巢所在，天行者夫妻攜手進攻，加上莉亞帶來凱普杜倫、凱爾可塔恩等四名絕地大師增援，終能殺死韋爾克並瓦解黑巢，然而他們卻始終不見蘿米普羅蹤影，阿蕾瑪也負傷逃走。得知真相的圖爾與奇斯達成停戰協議，藉由哈普茲財團的幫助，克利克移居至索羅夫婦發現的烏特蓋圖（Utegetu）星雲，與奇斯優勢彼此互不侵犯。
賈古德釋放了被俘的洛巴卡，圖爾也解除了絕地們與蜂巢的聯結，但珍娜與澤克卻還有強烈的聯繫，甚至可以讀取彼此的思想，和賈古德形成了尷尬的三角關係。雖然 R2D2 長年來守口如瓶，但路克此次終於從其記憶庫中見到了自己的母親帕米艾米達拉，開始了解父母的過去。莉亞則決定正式專注於絕地之道，開始在薩巴大師底下接受訓練，一切紛紛擾擾看似告一段落。
隱身之后
一年後，珍娜與澤克依舊有著心靈上的聯結，並在一次貝斯平的任務中驚訝地發現黑巢依舊存在的證據。另一方面，現今克利克所居住的星球沃特巴（Woteba）出現了一種腐蝕性的酸，很快就在克利克之間形成了流行病，令之退化甚至死亡。這是一種古老的環境防禦系統，其使用的奈米科技甚至超越了銀河聯盟，不僅沃特巴，烏特蓋圖星雲的其他星球也出現了同樣的情況，克利克進而懷疑銀河聯盟與絕地武士給他們移居此地是場陰謀。路克與韓來到沃特巴追尋黑巢的下落，阿蕾瑪卻出現在他們面前，提出了一份交易。
黑巢的領袖確確實實就是蘿米普羅，當年墜機的當下，瑞納不顧身上已著火受傷，奮力將她和韋爾克拖出機身，救了他們一命。然而與瑞納不同，融入了克利克的蘿米以黑暗面知識創建了哥洛戈蜂巢，將自己隱藏起來成為暗中操盤的「隱身之后」（Unseen Queen）。她的目的是讓克利克擴張至全銀河，將其他物種都同化為聯結者，進以成為一切的主宰。隨著蘿米手下第一把交椅「夜先驅」（Night Herald）韋爾克死亡，這個頭銜已由阿蕾瑪繼承，她一方面試圖混淆絕地對黑巢真相的認知，一方面也以解鎖 R2D2 的路克父母資訊作為交換不干涉黑巢的條件。
路克當然沒有接受這筆交易，但阿蕾瑪還是解鎖了安納金向帕米承諾自己會救她的紀錄情境，並拒絕返回絕地之列。傑森帶著如今感情很好的表弟班到安鐸露營，卻收到了譚妮兒發來的消息，便動身前往哈普茲。在對方引領下，傑森見到一個女嬰，隨即明白他正看著自己的親生骨肉，譚妮兒以原力拖延了女兒的成長與出生，保守了傑森為其生父的秘密。然而為了奪回政權，譚妮兒的祖母塔雅試圖暗殺嬰兒，最終雖然被傑森他們阻止，但與塔雅聯手的刺客正是來自黑巢，傑森同時還見到了未來的永恆戰爭預象。
在黑巢的煽動下，領導克利克的圖爾對於現今困境相當憤怒，欲脫離烏特蓋圖星雲，再次進犯奇斯領域。另外，與黑巢合作的海盜與走私客也引發事端，銀河聯盟國家元首奧瑪斯認為絕地無力處理克利克，決定祭出封鎖行動，派遣第五艦隊阻止殖民地擴張。由於路克的缺席，奧瑪斯也指派親政府的柯蘭霍恩擔任絕地武士團的臨時領袖，凱普杜倫則挺身捍衛路克與莉亞，兩派的對立令絕地組織產生了裂痕。此時人在沃特巴的路克與韓已被圖爾拘禁，這段期間他見到了 R2 記憶庫中安納金在絕地聖殿執行密令 66 的影像畫面，並察覺克利克提供給銀河聯盟的玻璃藝術品中藏有黑巢的刺客。
他們後來成功脫困，在氣態巨星突斯肯之眼（Tusken's Eye）發現黑巢與結盟的海盜正在建造十五艘大型巢船，準備提升與奇斯優勢的敵對態勢。衝突在銀河聯盟進行封鎖的穆爾古閘道口（Murgo Choke）爆發，藉由藏身於藝術品中，黑巢刺客得以從勝利級星際驅逐艦「亞可巴上將號」內部發動攻擊，雖然莉亞與薩巴盡力阻止，莉亞也再次與阿蕾瑪交手，兩人爆發光劍對決，但驅逐艦最終還是落入克利克之手。躲在巢船上，路克與韓也抵達了戰場，他們與瑪拉試圖炸毀巢船的超空間引擎，同時對付藏身旗艦的黑巢女王蘿米。
眾人的行動癱瘓了十一艘巢船，路克也終於對決蘿米，但隱身之后在原力的黑暗面中保持不可視的狀態，利用的正是眾人心中懷疑的情感。藉由讓路克見到過去父親追殺絕地幼徒的情境，其心中產生的懷疑與不安如今也成了她隱身力量的來源，最終蘿米得以脫逃，亞可巴上將號與剩下的巢船突破了銀河聯盟的封鎖。停戰協議宣告破裂，加上先前傑森為阻止戰事而與珍娜一同突襲了奇斯設施，令奇斯優勢與銀河聯盟及絕地的信任關係瓦解，在這風風雨雨之中，「蜂湧之戰」（Swarm War）拉開了序幕…
蜂湧之戰
全面戰爭爆發，身為聯結者的珍娜、澤克與傑森等六名絕地再次支援克利克，擔任奇斯部隊指揮官的賈古德又一次被迫與前女友為敵，儘管如此，傑森依舊在戰場上救了賈古德的命。因應情勢的升級，銀河聯盟請託傳奇的帝國將領斐列恩擔任最高指揮官，路克也召喚絕地武士返回奧瑟斯，雖然傑森、塔希里、洛巴卡等人接受了召喚，但珍娜與澤克堅決留下來繼續為他們同情的克利克族奮戰。
在奧瑟斯的新絕地聖殿，路克天行者對絕地組織當今的分裂困境提出改革，宣布自己成為絕地宗師（Jedi Grand Master），正如當年的尤達全權執掌新絕地組織。絕地就此與銀河聯盟政治圈分道揚鑣，退出與奧瑪斯共組的高級議會，另組新的絕地議會。路克也要求無法將絕地職責擺在首位的人退出組織，像譚妮兒等人紛紛辭退了絕地身分，雖然莉亞覺得路克這麼做很粗暴，但她還是能理解兄長的理念。經過與傑森的討論，路克認為結束戰爭的最好辦法，除了得殺死黑巢的領袖蘿米普羅，還必須將圖爾從克利克的領導位置拔除。
藉由同化成聯結者等手段，吉諾西斯人等昆蟲種族紛紛成為克利克的盟友，而生產巴克他醫療溶液的蒂法拉（Thyferra）也爆發政變，被克利克全面接管。路克、瑪拉、傑森在一次的任務中攻入哥洛戈巢船，試圖殺死蘿米，但最後不僅以失敗告終，瑪拉與傑森還受到了重傷。由於先前見到了安納金在穆斯塔法對帕米鎖喉的影像紀錄，路克也將之與現狀重疊，害怕自己會失去瑪拉。為了不再讓蘿米在下次的對決中有機可趁，他勢必得徹底擺脫這份恐懼與悲痛，在傑森的建議下，路克觀看了剩餘的 R2 紀錄，見證了安納金與歐比王的對決，最終看著母親在他們兄妹出生後才嚥下最後一口氣。
隨著奇斯軍隊攻入了克利克的世界特努佩（Tenupe），戰事也升溫至最高潮。奇斯十萬大軍降落至地表，克利克則在珍娜與澤克的領軍下從地面與空中展開反擊，於此同時莉亞發現奇斯人打算使用一種寄生蟲炸彈，能徹底殲滅所有克利克族。阿蕾瑪以她的匿蹤 X 戰機摧毀了奇斯載具，但有兩枚炸彈掉在星球表面，成了雙方爭奪的目標。韓前往搜救被賈古德費爾領軍擊落的女兒與澤克，莉亞則擊毀賈古德的爪式戰機但留了他一條命，之後在叢林中碰上同樣尋找著炸彈的阿蕾瑪，兩人展開第三次對決。絕地終擊敗了墮入黑暗面的夜先驅，阿蕾瑪落入一頭大蜘蛛的嘴裡，莉亞和薩巴也找到並在一條河底下引爆了寄生蟲炸彈，解除了危機。
軌道上的艦隊戰，斐列恩率領銀河聯盟部隊增援奇斯，投入了一艘執行者級星際驅逐艦，以及包含「蒙莫斯瑪號」在內的兩艘帝國級驅逐艦。路克天行者滲透了被克利克奪走的「亞可巴上將號」，與圖爾展開光劍對決，砍斷對方手臂後成功制服了這個聯結之王。明白母親並非死於父親之手，如今心中不再迷惘的路克又一次對上蘿米，終於取得久違的勝利，隨著隱身之后的死亡，黑巢的影響也就此告終。珍娜與澤克被千年鷹號救出戰場並斷了與蜂巢的聯結，路克帶著昏迷的圖爾返回絕地組織，蜂湧之戰劃下句點。
失去了領袖，克利克族再次回到原本盲目混亂的狀態，停止了擴張行徑，隨著該昆蟲種族的發展受到抑制，奇斯族也結束了敵對行動。瑞納圖爾被武士團羈押接受長期治療，莉亞正式成為成熟的絕地武士，洛巴卡與塔希里等三人則因戰時對瑞納的母親有所洩漏，被路克視為對組織的背叛，如今被流放達可巴。諸事塵埃落定，然而由路克天行者全權掌控的絕地武士團，這個新體制所造成的隱憂，日後將會面臨怎麼樣的考驗，就連路克本人都說不準。（待續） → 40 ABY
圖片來源：Wookieepedia